Maisteritutkintojen määrällä mitattuna Jyväskylän yliopisto on Suomen toiseksi suurin yliopisto. Luonnontieteet, ihmistieteet, liikunta ja terveys sekä opettajankoulutus profiloivat Jyväskylän yliopiston tutkimusta, opetusta sekä innovaatiotoimintaa.
Jyväskylän yliopisto tarjoaa lähes 80 pääainetta ja yli 100 oppiainetta seitsemässä eri tiedekunnassa, jotka ovat:
Ainoastaan Jyväskylän yliopistossa tarjolla olevia pääaineita ovat liikunta- ja terveystieteellisen koulutuksen ohella taidekasvatus, taloushistoria, johtaminen, museologia sekä useat informaatioteknologian ja viestintätieteiden oppiaineet.
| Keskiarvo | Määrä | Rec. | ||
| 4,5 | 6 | 83 % |